Η Αθήνα ιδρύθηκε το 1830 και έγινε η δεύτερη κομητεία της κομητείας Monroe όταν η κομητεία Monroe διαιρέθηκε για να σχηματιστεί η κομητεία Lowndes . Η Αθήνα ονομάστηκε για την πόλη στην Ελλάδα , καθώς οι ιδρυτές της κοινότητας ήλπιζαν ότι θα γινόταν «πόλη της μάθησης». Η Αθήνα βρισκόταν σε μια γραμμή βαγονιών που έτρεχε από την περιοχή Natchez έως το Eastport .
Η Αθήνα είχε κάποτε έξι καταστήματα, τρία ξενοδοχεία, δύο εκκλησίες, δύο ταβέρνες και ένα σχολείο. Στη δεκαετία του 1840, η Αθήνα είχε πληθυσμό 500 κατοίκων. Το 1849, το δικαστήριο της Αθήνας κάηκε και μέχρι το 1857 η έδρα της κομητείας μεταφέρθηκε δυτικά του ποταμού Tombigbee στο Αμπερντίν . Μετά τη μετακίνηση της έδρας του νομού, η Αθήνα άρχισε σιγά σιγά να χάνει τον πληθυσμό της.
Με την επωνυμία Αθήνα λειτούργησε ταχυδρομείο από το 1830 έως το 1873
Η πρώην φυλακή της κομητείας Monroe (γνωστή και ως φυλακή της Αθήνας) χτίστηκε το 1845 και είναι το παλαιότερο υπάρχον δημόσιο κτίριο στην κομητεία Monroe. Είναι καταχωρημένο στο Εθνικό Μητρώο Ιστορικών Τόπων .